|
|
Studium dynamického chování směsi H2O/D2O pomocí NMR relaxací
Dvořák, Petr ; Lang, Jan (vedoucí práce) ; Hanyková, Lenka (oponent)
Název práce: Studium dynamického chování směsi H2O/D2O pomocí NMR relaxací Autor: Petr Dvořák Katedra: Katedra fyziky nízkých teplot Vedoucí diplomové práce: doc. RNDr. Jan Lang, Ph.D., Katedra fyziky nízkých tep- lot Abstrakt: Předmětem této diplomové práce je chemická výměna ve směsi lehké a těžké vody, která byla studována metodami NMR spektroskopie vysokého rozlišení. První část této práce se zabývá metodikou přípravy vzorků a metodikou měření re- laxačních dob směsi lehké a těžké vody. Zde byly řešeny experimentální komplikace s vymýváním iontů ze skla kyvety, odplyněním vzorků, radiačním dampingem a za- hříváním vzorku radiofrekvenčními pulsy. V druhé části této práce byly naměřeny re- laxační parametry chemické výměny vybraného vzorku při různých teplotách. Bylo zde navrženo několik interpretací naměřených dat - ionizace, molekulární clustery a izotopová rovnováha. Klíčová slova: NMR, relaxace, voda, dynamika, chemická výměna
|
|
|
NMR Study of Oligonucleotide Structures
Římal, Václav ; Štěpánková, Helena (vedoucí práce) ; Spěváček, Jiří (oponent) ; Sychrovský, Vladimír (oponent)
Název práce: NMR studium oligonukleotidových struktur Autor: Václav Římal Katedra: Katedra fyziky nízkých teplot Vedoucí disertační práce: Prof. RNDr. Helena Štěpánková, CSc., Katedra fyziky nízkých teplot Abstrakt: Dynamika nukleových kyselin hraje zásadní roli při jejich inter- akcích s proteiny. Změny ve stabilitě a flexibilitě DNA vyvolané obměnou sekvence či chemickou modifikací ovlivňují řadu procesů i bez podstat- ného dopadu na prostorovou strukturu. Přechod spojený s táním DNA jsme podrobně studovali pomocí ana- lýzy rezonančních křivek v teplotně závislých spektrech 1H NMR. Po- zorovali jsme, že chemické posuvy a termodynamiku dvoušroubovice značně ovlivňuje sekvence bází, a to nejen nejbližších sousedů. Zvláště citlivý na vzdálenější okolí je CpG motif, u něhož v případě jednoho oligonukleotidu dokonce dochází k neočekávanému strukturnímu pře- chodu. Rovnovážné i kinetické parametry tání a daleký dosah efektu methylace cytosinu svědčí o vysoké kooperativitě při rozpadu duplexu. Dvoustavový model tání lze aplikovat i na část transkripčního elementu, která dle našich výsledků prokazatelně tvoří vlásenku se šestičetnou smyčkou. Dále jsou v práci popsány vlastnosti shlukování riboguanosin- a deoxyriboguanosin-5'-monofosfátů do vícemolekulárních komplexů. Tato...
|
|
|
Studium dynamického chování směsi H2O/D2O pomocí NMR relaxací
Dvořák, Petr ; Lang, Jan (vedoucí práce) ; Hanyková, Lenka (oponent)
Název práce: Studium dynamického chování směsi H2O/D2O pomocí NMR relaxací Autor: Petr Dvořák Katedra: Katedra fyziky nízkých teplot Vedoucí diplomové práce: doc. RNDr. Jan Lang, Ph.D., Katedra fyziky nízkých tep- lot Abstrakt: Předmětem této diplomové práce je chemická výměna ve směsi lehké a těžké vody, která byla studována metodami NMR spektroskopie vysokého rozlišení. První část této práce se zabývá metodikou přípravy vzorků a metodikou měření re- laxačních dob směsi lehké a těžké vody. Zde byly řešeny experimentální komplikace s vymýváním iontů ze skla kyvety, odplyněním vzorků, radiačním dampingem a za- hříváním vzorku radiofrekvenčními pulsy. V druhé části této práce byly naměřeny re- laxační parametry chemické výměny vybraného vzorku při různých teplotách. Bylo zde navrženo několik interpretací naměřených dat - ionizace, molekulární clustery a izotopová rovnováha. Klíčová slova: NMR, relaxace, voda, dynamika, chemická výměna
|
host ::
RSS.